農藥制藥廢水處理達標難度較大，原因在于該類廢水水量小、毒性大，含有高濃度有毒有機污染物、成分復雜、難降解物質較多，且無機鹽濃度較高。農藥制藥廢水所含有機物大多為致畸、致癌、致突變物質，危害性極大，如隨意排放會導致水質污染加劇，并威脅人類健康。農藥制藥廢水具有較高的毒性和鹽度，微生物無法生存，故不適合采用生物法對其進行直接處理，即使采用生物法處理也很難達到排放標準。目前，運用合適的預處理技術使農藥制藥廢水的可生化性提高、毒性降低是農藥廢水處理的關鍵。由于高級氧化方法反應快速徹底、沒有選擇性，因而作為預處理手段具有較大的優勢。

高級氧化方法作為廢水預處理方法的研究已經成為一大熱點，尤其是對高濃度有機廢水的預處理。高級氧化方法的共同特點是能生成具有強氧化性的羥基自由基（^.OH），^.OH氧化降解有機物，終降解產物為H₂O和CO₂。這種方法有諸多優點：（1）反應中可產生大量活潑^.OH以及其他自由基，氧化能力很強，且可作為中間產物誘發后面的鏈式反應；（2）^.OH與廢水中的污染物直接反應，無二次污染；（3）該方法便于操作，可氧化處理某些微量有機物，以達到不同的處理目標；（4）能獨自降解廢水，也能聯合其他高級氧化方法或生物工藝使用，降低處理成本。但由于農藥制藥廢水自身的特殊性質，高級氧化法在應用上仍有許多缺陷，如費用高、規模小等。

目前主要的高級氧化方法有：空氣氧化法、光催化氧化法、超臨界水氧化法、電催化氧化法和臭氧氧化法等。近年來，微波和超聲在環境領域中的應用受到研究者的關注，并且已成功應用于廢水、廢氣、固廢的處理方面。關于微波或超聲方法與高級氧化方法聯用處理農藥制藥廢水的研究也越來越多。

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