工業污水處理的微生物技術主要是利用微生物的代謝反應過程和生物合成產物(包括酶) 對污染環境進行監測、評價、整治以及修復的單一或綜合性的現代化人工技術系統。它不僅包含了生物技術所有的特點，還融合了環境污染防治以及其他工程技術，目前已逐步發展成為一種經濟效益和環境效益俱佳的、能解決日益嚴重的(尤其是水污染) 環境問題的有效手段之一。

污水處理微生物菌劑菌種結構單一，當前市場上的污水處理菌劑多樣，包括氨氮去除劑、COD降解劑、反硝化菌劑等，它們之中大多只含有1種或2種不同種類的微生物，這些微生物大多是一些常見的微生物種群，對某些特定環境中的易處理的污水能夠有較好的效果，而對于一些含有大量難以降解的污染物，比如芳香烴、抗生素等的污水以及極端環境下（比如高鹽污水）的處理效果不佳。

對策：開發出功能更強大的超級細菌，在進行專一性降解菌株分離的同時，采用了現代微生物分子生態技術對水處理系統中的微生物種群進行分析，確立水處理系統中微生物的種群結構，從而為分離純化出專一性降解能力強、可與現有水處理體系中微生物種群共存的菌株或菌群提供依據和支撐。

多種微生物共生技術讓3種以上微生物共生一個環境不相互蠶食，快速繁殖。這樣避免了微生物處理污染物的單一性，降解更多種類的污染物，微生物菌群根據當地的環境進行培養，使其適應需要處理的環境特性，做到因地制宜，并且確保做好微生物安全性問題。

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